Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hacd2Q9D3B1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hacd2Q9D3B1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hacd2Q9D3B1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hacd2Q9D3B1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hacd2Q9D3B1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 326.2 ms