Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rufy3Q9D394 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rufy3Q9D394 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rufy3Q9D394 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms