Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Necap2Q9D1J1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Necap2Q9D1J1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms