Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cysrt1Q9D1E4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms