Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd3Q9D176 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd3Q9D176 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd3Q9D176 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms