Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lsm12Q9D0R8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lsm12Q9D0R8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lsm12Q9D0R8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms