Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdca7Q9D0M2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca7Q9D0M2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms