Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gtf2e1Q9D0D5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms