Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp3Q9CZX0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elp3Q9CZX0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms