Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssbp2Q9CYZ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssbp2Q9CYZ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms