Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prelid3bQ9CYY7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prelid3bQ9CYY7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms