Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem39aQ9CYC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39aQ9CYC3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms