Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrps28Q9CY16 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrps28Q9CY16 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mrps28Q9CY16 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mrps28Q9CY16 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mrps28Q9CY16 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrps28Q9CY16 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrps28Q9CY16 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrps28Q9CY16 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrps28Q9CY16 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrps28Q9CY16 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrps28Q9CY16 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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