Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm5Q9CXE0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm5Q9CXE0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms