Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Alpk1Q9CXB8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alpk1Q9CXB8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alpk1Q9CXB8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms