Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpusd4Q9CWX4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms