Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NubplQ9CWD8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NubplQ9CWD8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NubplQ9CWD8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms