Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smc3Q9CW03 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smc3Q9CW03 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms