Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atxn3Q9CVD2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atxn3Q9CVD2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms