Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sycp2Q9CUU3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Sycp2Q9CUU3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Sycp2Q9CUU3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Sycp2Q9CUU3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms