Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930553M12RikQ9CUH1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms