Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sft2d3Q9CSV6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sft2d3Q9CSV6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms