Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nrxn1Q9CS84 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nrxn1Q9CS84 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms