Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRC3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRC3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CRC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CRC3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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