Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vta1Q9CR26 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vta1Q9CR26 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms