Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR09

Ufc1, Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufc1Q9CR09 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ufc1Q9CR09 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufc1Q9CR09 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms