Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4931417E11RikQ9CR05 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4931417E11RikQ9CR05 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4931417E11RikQ9CR05 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms