Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Polr3kQ9CQZ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms