Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg12Q9CQY1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms