Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Riok2Q9CQS5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Riok2Q9CQS5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Riok2Q9CQS5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Riok2Q9CQS5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Riok2Q9CQS5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Riok2Q9CQS5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Riok2Q9CQS5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms