Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2Q9CQP2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc2Q9CQP2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc2Q9CQP2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms