Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl35Q9CQL6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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