Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer1Q9CQL2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer1Q9CQL2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms