Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdm1Q9CQK3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdm1Q9CQK3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms