Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snrpb2Q9CQI7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpb2Q9CQI7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpb2Q9CQI7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms