Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4921530L21RikQ9CQ47 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4921530L21RikQ9CQ47 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4921530L21RikQ9CQ47 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms