Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc18Q9CQ07 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms