Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms