Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg3Q9CPX6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atg3Q9CPX6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atg3Q9CPX6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms