Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930519G04RikQ9CPT7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930519G04RikQ9CPT7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930519G04RikQ9CPT7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930519G04RikQ9CPT7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930519G04RikQ9CPT7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930519G04RikQ9CPT7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930519G04RikQ9CPT7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930519G04RikQ9CPT7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930519G04RikQ9CPT7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930519G04RikQ9CPT7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms