Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Bap1Q99PU7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Bap1Q99PU7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bap1Q99PU7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms