Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ino80bQ99PT3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80bQ99PT3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80bQ99PT3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms