Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trem2Q99NH8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trem2Q99NH8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms