Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brms1Q99N20 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brms1Q99N20 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brms1Q99N20 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms