Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrrtQ99MR6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms