Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrapQ99MP8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BrapQ99MP8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BrapQ99MP8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms