Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KarsQ99MN1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KarsQ99MN1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KarsQ99MN1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms