Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtprtQ99M80 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprtQ99M80 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
PtprtQ99M80 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprtQ99M80 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
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