Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd3Q99LY2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms