Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pagr1aQ99L02 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pagr1aQ99L02 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms